Peptitler ve Proteinler

AMİNO ASİTLER, PEPTİTLER VE PROTEİNLER II:

Peptitler ve Proteinler

Peptitler amino asitlerden oluşmuş zincirlerdir.

İki amino asit molekülü bir amit bağı ile kovalent olarak birbirine bağlandıklarında bir dipeptit oluşur.

Bu bağın oluşumu için bir amino asidin α-karboksi grubundan ve diğer bir amino asidin α-amino grubundan bir molekül suyun ayrılması gerekir.

Peptit bağı oluşumu bir kondensasyon reaksiyonudur.

Biyokimyasal şartlar altında bu reaksiyonun dengesi amino asit oluşumu yönündedir.

Reaksiyonun termodinamik olarak tercih edilir hale gelmesi için karboksil grupları kimyasal olarak aktive edilmelidir.

Üç amino asit iki peptit bağı ile birbirlerine bağlandıklarında bir tripeptit ve benzer şekilde dört amino asitten tetrapeptit ve beş amino asitten pentapeptit oluşur.

Genellikle 8 ve üzeri amino asitten oluşan peptitler oligopeptit olarak isimlendirilirler.

20 ve üzeri amino asitten oluşan peptitler ise polipeptit olarak adlandırılırlar.

Üç boyutlu yapıya katlanarak bir fonksiyon gösteren polipeptitlere protein adı verilir.

 Peptit yapısında yer alan bir amino asit birimi (amino grubundan bir hidrojen atomu ve karboksi grubundan bir hidroksil molekülü kaybetmiş olan kısım) genellikle amino asit kalıntısı olarak adlandırılır.

Uçta serbest bir α-amino grubu taşıyan amino asit kalıntısı amino terminali veya N-terminali olarak, serbest bir α-karboksil grubu taşıyan amino asit kalıntısına karboksi terminali veya C-terminali denir.

Peptitler zincirin her iki ucunda serbest bir amino ve serbest bir karboksil grubu taşırlar.

Bu gruplar pKa değerlerinin altında ve üstünde farklı yüklenirler.

Ayrıca zincir içindeki iyonlaşabilen yan gruplara sahip amino asit kalıntıları da pKa değerlerinin altında ve üstünde farklı yüklenirler.

Peptit bağı oluşumuna katılan amino ve karboksil grupları ise yük alamazlar.

Kaynak: http://eczacilik.anadolu.edu.tr/bolumSayfalari/belgeler/03%20Amino%20asitler,%20Peptitler%20ve%20Proteinler%20II_20140404062844.pdf

Bir cevap yazın